В состав историко-культурного и ландшафтного музея-заповедника «Пустозерск», основанного в 1991 году, входят памятники истории и культуры, находящиеся в г. Нарьян-Маре, в д. Устье, а так же значительная территория (свыше 620 га) на месте бывшего поселения Пустозерск, которая находится в 26 километрах на юго-запад от Нарьян-Мара, на берегу Городецкого озера, на территории Заполярного района Ненецкого автономного округа. Ближайший населенный пункт – д. Устье.
Территория характеризуется наличием живописных и уникальных ландшафтов. Городецкое озеро и прилегающие к нему территории озер, рек, протоков, лесотундровой и тундровой растительности, богатого животного и растительного мира, наличие археологических, историко-культурных и природных памятников делает эту территорию особо ценной, как в научном, так и в культурном отношении.
Территория музея сочетает в себе разнообразные ландшафты: елово – березовые и березовые леса, пойменные и суходольные луга, развеваемые пески и болота, ивняки и ерниковые заросли, реки и озера. Но особой ценностью музея-заповедника является реликтовый островной ельник, находящийся в урочище Малый бор, а так же кедр (Pínus sibírica), таежный вид, граница распространения которого приходит в 500 километрах к югу.
Городище сохранило ландшафтные особенности и природное окружение, а также элементы топографии сельского поселения, включая фундаменты отдельных зданий. В северо-западной части памятника находится старое церковное кладбище. Культурный слой Пустозерского городища со стороны озера Городецкое (южная и восточная часть ОКН) составляет почти 4 м и частично представлен ледяной линзой.
В настоящее время на территории музея-заповедника выявлено и исследовано большое количество археологических, исторических и природных памятников - это не только древнее поселение Пустозерск, но и городище на р. Гнилка (VI-X вв.), святилище на р.Гнилка (VI-XIII вв.), в окрестностях - поселение Югорская сопка (VI-X вв.), сопка Сиера - священное место ненцев, ряд стоянок древнего человека от эпохи бронзы до раннего средневековья, древнее русско-ненецкое кладбище.